Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms