Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms