Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUCLA2Q9P2R7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUCLA2Q9P2R7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUCLA2Q9P2R7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUCLA2Q9P2R7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUCLA2Q9P2R7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms