Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms