Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9Q9P2J2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms