Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms