Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms