Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms