Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms