Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF12Q99081 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms