Protein–RNA interactions for Protein: Q96L50

LRR1, Leucine-rich repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRR1Q96L50 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRR1Q96L50 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms