Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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CLDN23Q96B33 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLDN23Q96B33 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLDN23Q96B33 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLDN23Q96B33 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN23Q96B33 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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