Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms