Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms