Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms