Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP13Q86W25 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms