Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms