Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSTM1Q6UX27 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VSTM1Q6UX27 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms