Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms