Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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C1orf61Q13536 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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