Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCP2Q13094 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LCP2Q13094 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms