Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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