Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms