Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms