Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms