Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms