Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms