Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms