Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms