Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPTEP56180 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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