Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms