Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPAP53621 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COPAP53621 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COPAP53621 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COPAP53621 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COPAP53621 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COPAP53621 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COPAP53621 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COPAP53621 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COPAP53621 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COPAP53621 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPAP53621 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPAP53621 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPAP53621 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPAP53621 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms