Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2D1P51668 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms