Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TGM4P49221 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TGM4P49221 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TGM4P49221 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TGM4P49221 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TGM4P49221 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TGM4P49221 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM4P49221 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms