Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms