Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT2P45379 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms