Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms