Protein–RNA interactions for Protein: P35080

PFN2, Profilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN2P35080 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PFN2P35080 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PFN2P35080 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms