Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms