Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms