Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYF6P23409 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms