Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HRCP23327 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HRCP23327 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
HRCP23327 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HRCP23327 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HRCP23327 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HRCP23327 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HRCP23327 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HRCP23327 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HRCP23327 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HRCP23327 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HRCP23327 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HRCP23327 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HRCP23327 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HRCP23327 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HRCP23327 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HRCP23327 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HRCP23327 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HRCP23327 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HRCP23327 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HRCP23327 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HRCP23327 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HRCP23327 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms