Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2P22307 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2P22307 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2P22307 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2P22307 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2P22307 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2P22307 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2P22307 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2P22307 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2P22307 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2P22307 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2P22307 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2P22307 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2P22307 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2P22307 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2P22307 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2P22307 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2P22307 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2P22307 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2P22307 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2P22307 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2P22307 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2P22307 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2P22307 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2P22307 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2P22307 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2P22307 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2P22307 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2P22307 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2P22307 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2P22307 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2P22307 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2P22307 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2P22307 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2P22307 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2P22307 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2P22307 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2P22307 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2P22307 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2P22307 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2P22307 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2P22307 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms