Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms