Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms