Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCF2P10911 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCF2P10911 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCF2P10911 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCF2P10911 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCF2P10911 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCF2P10911 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCF2P10911 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCF2P10911 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2P10911 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms