Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBP07199 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBP07199 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms