Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV3-11P04433 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms