Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF1O43189 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF1O43189 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF1O43189 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF1O43189 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF1O43189 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF1O43189 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF1O43189 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF1O43189 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF1O43189 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF1O43189 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF1O43189 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF1O43189 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF1O43189 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF1O43189 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF1O43189 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF1O43189 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF1O43189 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF1O43189 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF1O43189 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF1O43189 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF1O43189 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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