Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms